丽水出入境检验检疫局前身为丽水进出口商品检验局，建于1994年8月12日。1999年，根据国务院机构改革方案，原国家进出口商品检验局、国家动植物检疫局、国家卫生检疫局"三检"职能合一，组建新的出入境检验检疫局，中华人民共和国丽水出入境检验检疫局，于1999年12月1日正式挂牌。丽水出入境检验检疫局是负责丽水市出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验的行政执法单位，是浙江出入境检验检疫局设在丽水的直属机构，实行垂直管理体制。
    丽水出入境检验检疫局内设办公室、检验检疫一处、检验检疫二处、检务处等4个处室，建有商检认可综合实验室1个。办公室负责协调机关日常各项工作；负责许可证考核、产品和体系认证及综合业务、政策法规等工作。检验检疫一处主要负责出入境动植物及其产品、进出口食品的检验检疫工作。检验检疫二处负责进出口机电仪、轻工、纺织品、服装、化矿、包装等商品的检验鉴定工作。检务处负责出入境检验检疫证书证单、普惠制原产地证、一般原产地证的签发；检验检疫报检、计费、签证、放行及流程管理；负责报检员的管理、许可证的申请以及接受咨询工作。

办公地址：丽水市花园路636号。
联系电话：0578-2130360、总机：2202211。
传真：2116341、2171152。